ใช้แมงกานีสออกซาเลตไดไฮเดรตในอุตสาหกรรมการผลิตสารเคมีเฉพาะทาง โดยมักเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบแมงกานีสอื่นๆ ที่ใช้ในกระบวนการเร่งปฏิกิริยา หรือใช้ในงานวัสดุศาสตร์ เช่น การผลิตเซรามิกส์หรือออกไซด์แมงกานีสที่มีความบริสุทธิ์สูง นอกจากนี้ยังมีการใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษาคุณสมบัติของสารประกอบแมงกานีสในรูปแบบต่างๆ โดยเฉพาะในระบบการถ่ายโอนอิเล็กตรอนและการเกิดปฏิกิริยาออกซิเดชัน-รีดักชัน