HJC0350 ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเป็นตัวยับยั้งที่แรงและเลือกเฉพาะของเอนไซม์ cyclin-dependent kinase 9 (CDK9) การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในการศึกษากระบวนการเซลล์ เช่น การควบคุมการถอดรหัส (transcription regulation), การตายของเซลล์ (apoptosis) และการควบคุมวัฏจักรเซลล์ (cell cycle control) นักวิจัยใช้ HJC0350 เพื่อตรวจสอบผลกระทบต่อเซลล์มะเร็ง โดยเฉพาะในการทำความเข้าใจศักยภาพในการยับยั้งการเจริญเติบโตของเนื้องอกโดยการรบกวนการถอดรหัสที่ไกล่เกลี่ยโดย CDK9 ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่ากในการศึกษาก่อนคลินิกที่มุ่งพัฒนาการบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการสำรวจบทบาทของมันในกระบวนการจำลองแบบไวรัส เนื่องจาก CDK9 มีส่วนเกี่ยวข้องในการถอดรหัสของไวรัสบางชนิด ซึ่งให้ข้อมูลเชิงลึกในการพัฒนายาต้านไวรัส