FMK 9a ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะสารยับยั้งที่แรงและเลือกสรรต่อคาสเพส (caspases) ซึ่งเป็นตระกูลของโปรตีเอสซิสเตอีนที่เกี่ยวข้องกับอะพอพโทซิส (การตายของเซลล์แบบตั้งโปรแกรม) การประยุกต์ใช้ของมันมีความสำคัญในการศึกษากลไกของการตายและการรอดชีวิตของเซลล์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการวิจัยมะเร็ง ซึ่งการทำความเข้าใจเส้นทางอะพอพโทซิสสามารถนำไปสู่การพัฒนาการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมาย นอกจากนี้ FMK 9a ยังถูกใช้ในประสาทวิทยาศาสตร์เพื่อสำรวจบทบาทของคาสเพสในโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท เช่น อัลไซเมอร์และพาร์กินสัน ซึ่งการตายของเซลล์ผิดปกติเป็นปัจจัยหลัก มันยังช่วยในการตรวจสอบกระบวนการอักเสบ เนื่องจากคาสเพสมีบทบาทในการควบคุมการตอบสนองของภูมิคุ้มกัน นักวิจัยใช้ FMK 9a ในหลอดทดลองเพื่อยับยั้งกิจกรรมของคาสเพส ซึ่งช่วยให้พวกเขาสามารถแยกวิเคราะห์เส้นทางส่งสัญญาณเฉพาะและระบุเป้าหมายการบำบัดที่เป็นไปได้ การใช้ของมันมีความสำคัญในการส่งเสริมความรู้เกี่ยวกับกระบวนการเซลล์และพัฒนาการรักษาสำหรับโรคที่เกี่ยวข้องกับอะพอพโทซิสที่ควบคุมผิดปกติ