2-Chloro-1-methylpyridinium p-Toluenesulfonate ใช้เป็นสารเคมีตัวกลางในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะสำหรับการกระตุ้นกรดคาร์บอกซิลิกเพื่อสร้างเอสเทอร์หรือเอไมด์ มีประสิทธิภาพสูงในการจับคู่เปปไทด์ เพื่ออำนวยความสะดวกในการก่อตัวของพันธะเปปไทด์ระหว่างกรดอะมิโน นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทโรไซคลิก ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของปฏิกิริยา บทบาทในการส่งเสริมปฏิกิริยาอซิเลชันทำให้มีคุณค่าต่ออุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีภัณฑ์ละเอียด