2-(Aminooxy)acetic acid hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นตัวเรย์เจนต์สำหรับการป้องกันสารประกอบคาร์บอนิล โดยทำปฏิกิริยากับอัลดีไฮด์และคีโตนเพื่อสร้างออกซิม ซึ่งเป็นสารกลางที่เสถียร สามารถถูกถอดการป้องกันเพื่อคืนกลับสู่กลุ่มคาร์บอนิลเดิมได้ คุณสมบัตินี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอนที่ต้องการการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันอย่างเลือกสรร นอกจากนี้ ยังใช้เป็นบล็อกก่อสร้างในการเตรียมเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ รูปแบบไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลาย ทำให้สะดวกในการใช้ในสภาวะปฏิกิริยาที่มีน้ำ นอกจากนั้น ยังนำไปใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อปรับเปลี่ยนโครงสร้างของโปรตีนหรือเปปไทด์ โดยการเชื่อมต่อผ่านการสร้างออกซิมกับกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะ