ใช้ Malonic acid 13C3 เป็นสารประกอบที่ติดฉลากไอโซโทปแบบเสถียรในงานวิจัยเมแทบอลิซึม เพื่อติดตามเส้นทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษาวัฏจักรกรดซิตริก (citric acid cycle) และการสังเคราะห์กรดไขมัน การเสริมคาร์บอน-13 ช่วยให้สามารถติดตามการไหลของคาร์บอนในเมแทบอลิซึมของเซลล์ได้อย่างแม่นยำ โดยใช้เทคนิคเช่น NMR spectroscopy และ mass spectrometry เนื่องจากเป็นไอโซโทปที่ไม่กัมมันตภาพรังสี จึงปลอดภัยต่อการใช้ในระบบชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในงานทดลองติดฉลากไอโซโทปเพื่อศึกษาการไหลของเมแทบอลิซึมในเซลล์มะเร็ง จุลินทรีย์ และระบบพืช นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ที่ติดฉลากและในการศึกษาสิ่งแวดล้อมเพื่อตรวจสอบเส้นทางการย่อยสลายของสารประกอบอินทรีย์