สารฟอร์มาลดีไฮด์-¹³C ละลายในน้ำถูกใช้เป็นตัวติดตามไอโซโทปในงานวิจัยทางเคมีและชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษาเส้นทางการเผาผลาญของเซลล์ เนื่องจากไอโซโทปคาร์บอน-13 เป็นไอโซโทปที่ไม่กัมมันตภาพรังสีและปลอดภัยต่อการใช้งานในระบบชีวภาพ ทำให้เหมาะสำหรับการติดตามการรวมตัวของคาร์บอนในโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน คาร์โบไฮเดรต และกรดนิวคลีอิก ในงานวิจัยทางชีววิทยา สารนี้ใช้ในการศึกษาการสร้างสารอินทรีย์ในพืชผ่านกระบวนการสังเคราะห์ด้วยแสง โดยการติดตามการดูดซึมและการเปลี่ยนแปลงของคาร์บอน-13 จากฟอร์มาลดีไฮด์ไปเป็นน้ำตาลและสารชีวโมเลกุลอื่น ๆ นอกจากนี้ยังใช้ในเทคนิคการวิเคราะห์ด้วยแม่เหล็กนิวเคลียร์ (NMR) และสเปกโตรสโกปีมวล (Mass Spectrometry) เพื่อระบุโครงสร้างของโมเลกุลและการเปลี่ยนแปลงทางเคมีในระบบชีวภาพอย่างแม่นยำ ในอุตสาหกรรม เคมีไอโซโทปนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนายาและการศึกษาเภสัชจลนศาสตร์ โดยช่วยให้สามารถติดตามการกระจายตัวและการเปลี่ยนแปลงของสารออกฤทธิ์ในร่างกายได้อย่างชัดเจน โดยไม่รบกวนกระบวนการทางชีวภาพตามธรรมชาติ