กลูตาราลดีไฮด์เป็นสารเคมีที่มีการใช้งานอย่างกว้างขวางในหลายอุตสาหกรรม หลักๆ แล้วใช้เป็นสารฆ่าเชื้อและสารฆ่าเชื้อในวงการแพทย์และทันตกรรม ใช้ในการฆ่าเชื้ออุปกรณ์ทางการแพทย์ เช่น กล้องส่องภายในและเครื่องมือผ่าตัด เนื่องจากมีประสิทธิภาพสูงในการทำลายเชื้อแบคทีเรีย ไวรัส เชื้อรา และสปอร์

นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมบำบัดน้ำ รวมถึงหอระบายความร้อน ระบบน้ำอุตสาหกรรม และอุตสาหกรรมน้ำมันและก๊าซ เป็นสารฆ่าเชื้อเพื่อควบคุมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ ในอุตสาหกรรมฟอกหนัง ใช้เป็นสารเชื่อมขวางเพื่อเพิ่มความทนทานและคุณภาพของผลิตภัณฑ์หนัง

ในทางวิทยาศาสตร์ กลูตาราลดีไฮด์ใช้ในการตรึงตัวอย่างทางชีวภาพเพื่อการศึกษาด้วยกล้องจุลทรรศน์ รวมถึงกล้องจุลทรรศน์แสงและอิเล็กตรอน โดยช่วยรักษาโครงสร้างเซลล์ให้คงเดิม คุณสมบัติการเชื่อมขวางทำให้มีคุณค่าในแอปพลิเคชันอุตสาหกรรมต่างๆ เช่น การผลิตกาว เคลือบ และโพลิเมอร์

อย่างไรก็ตาม ควรใช้ด้วยความระมัดระวังเนื่องจากเป็นสารที่อาจก่อให้เกิดการระคายเคืองต่อผิวหนัง ระบบทางเดินหายใจ และอาจทำให้เกิดอาการแพ้ ควรใช้อุปกรณ์ป้องกันและมีการระบายอากาศที่ดี