เบตา-ดี-กาแลคโตส เพนตาอะซีเตต ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในรูปแบบที่ป้องกันของกาแลคโตส มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตคาร์โบไฮเดรตที่ซับซ้อนและไกลโคคอนจูเกต ซึ่งจำเป็นในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชกรรม สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการทำปฏิกิริยาไกลโคซิลเลชัน ซึ่งช่วยให้เกิดการสร้างพันธะไกลโคซิดิคอย่างเลือกสรรโดยไม่เกิดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โอลิโกซักคาไรด์ ซึ่งมีความสำคัญในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างเซลล์ การตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน และการรับรู้พยาธิ กลุ่มอะซิทิลของมันให้ความเสถียรในระหว่างการแปลงทางเคมี ทำให้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานที่เชื่อถือได้ในเคมีคาร์โบไฮเดรต