เมทิล-เบต้า-ไซโคลเดกซ์trin ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางเภสัชกรรมเพื่อเพิ่มการละลายและความเสถียรของยาที่ละลายน้ำได้ยาก โดยทำหน้าที่เป็นตัวนำส่งยาผ่านการก่อตัวของคอมเพล็กซ์การรวมตัวกับโมเลกุลที่ไม่ชอบน้ำ ซึ่งช่วยปรับปรุง bioavailability และการดูดซึมในร่างกาย ในด้านชีววิทยาเซลล์ ถูกนำมาใช้ในการปรับระดับคอเลสเตอรอลในเยื่อหุ้มเซลล์ เพื่อช่วยในการศึกษาลิพิดราฟต์และพลวัตของเยื่อหุ้มเซลล์ นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องสำอางในฐานะอิมัลซิไฟเออร์และสารทำให้เสถียร ซึ่งช่วยปรับปรุงเนื้อสัมผัสและอายุการเก็บรักษาของผลิตภัณฑ์ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันยังมีคุณค่าในการประยุกต์ใช้ด้านสิ่งแวดล้อมสำหรับการกำจัดมลพิษอินทรีย์ออกจากน้ำ