กลูตารัลดีไฮด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมต่างๆ โดยเฉพาะในด้านการฆ่าเชื้อ เนื่องจากมีคุณสมบัติในการทำลายจุลินทรีย์ได้ดี รวมทั้งแบคทีเรีย ไวรัส และสปอร์ จึงนิยมใช้เป็นสารฆ่าเชื้อในสถานพยาบาล เช่น สำหรับฆ่าเชื้ออุปกรณ์ทางการแพทย์ที่ไม่สามารถผ่านความร้อนได้ เช่น กล้องส่องต่างๆ ในอุตสาหกรรมน้ำมันและก๊าซ กลูตารัลดีไฮด์ใช้ในการควบคุมการเจริญเติบโตของแบคทีเรียในน้ำที่ใช้ในกระบวนการผลิต เพื่อป้องกันการกัดกร่อนท่อและปัญหาการอุดตัน นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมหนัง สำหรับกระบวนการฟอกหนัง เพราะช่วยทำให้โปรตีนในหนังเสถียรขึ้น และเพิ่มความทนทานต่อความร้อนและการย่อยสลาย ในห้องปฏิบัติการวิจัย กลูตารัลดีไฮด์ใช้เป็นสารกันเสียหรือตัวยึดตัวอย่างทางชีวภาพ เช่น ในการเตรียมตัวอย่างสำหรับกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน เนื่องจากสามารถรักษารูปร่างและโครงสร้างของเซลล์ได้ดี