ใช้กลูตารัลดีไฮด์เป็นสารฆ่าเชื้อและสารกันเสียที่มีประสิทธิภาพสูง โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมทางการแพทย์ เช่น ใช้สำหรับฆ่าเชื้อเครื่องมือแพทย์ที่ไม่สามารถฆ่าเชื้อด้วยความร้อนได้ เช่น กล้องส่องต่างๆ นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อทำให้ตัวอย่างชีวภาพคงตัวก่อนการศึกษาภายใต้กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน เพราะช่วยรักษารูปร่างและโครงสร้างของเซลล์ได้ดี ในอุตสาหกรรมน้ำมันและก๊าซ กลูตารัลดีไฮด์ใช้เป็นสารฆ่าเชื้อแบคทีเรียในน้ำที่ใช้ในกระบวนการผลิต เพื่อป้องกันการกัดกร่อนและการอุดตันที่เกิดจากจุลินทรีย์ ยังมีการใช้ในอุตสาหกรรมหนัง กระดาษ และสิ่งทอ เช่น ใช้ในการฟอกหนังเพื่อทำให้หนังทนทานต่อการย่อยสลายจากจุลินทรีย์ และใช้เป็นสารปรับปรุงคุณภาพในกระบวนการผลิตกระดาษ อย่างไรก็ตาม กลูตารัลดีไฮด์มีพิษและอาจระคายเคืองต่อผิวหนัง ตา และระบบทางเดินหายใจ จึงต้องใช้ด้วยความระมัดระวังและมีการควบคุมการสัมผัสอย่างเข้มงวด