ดี-ราฟฟิโนสถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารและเภสัชกรรมเนื่องจากคุณสมบัติทางกายภาพที่เป็นประโยชน์ มันทำหน้าที่เป็นพรีไบโอติกส์ ส่งเสริมการเจริญเติบโตของแบคทีเรียในลำไส้ที่มีประโยชน์ เช่น ไบฟิโดแบคทีเรียและแลคโตบาซิลลัส ซึ่งช่วยสนับสนุนสุขภาพการย่อยอาหาร ในผลิตภัณฑ์อาหาร มันทำหน้าที่เป็นสาร стабилизаторและสารปรับเนื้อสัมผัส เพิ่มอายุการเก็บรักษาและความรู้สึกในปากของผลิตภัณฑ์นมและเบเกอรี่

ในเทคโนโลยีชีวภาพ ดี-ราฟฟิโนสถูกใช้เป็นสารปกป้องการแช่แข็งในการถนอมเซลล์ เนื้อเยื่อ และเอนไซม์ ช่วยรักษาความสมบูรณ์ของโครงสร้างระหว่างกระบวนการแช่แข็งและละลายน้ำแข็ง นอกจากนี้ยังใช้ในอาหารเลี้ยงเชื้อสำหรับการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์แบบเลือกสรร โดยเฉพาะในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับยีสต์และเชื้อรา ซึ่งช่วยแยกแยะความสามารถทางเมแทบอลิซึม

นอกจากนี้ ดี-ราฟฟิโนสยังพบการใช้งานในงานวิจัยสำหรับศึกษาการเมแทบอลิซึมของคาร์โบไฮเดรตและกิจกรรมของเอนไซม์ โดยเฉพาะในขั้นตอนทดสอบที่เกี่ยวข้องกับ α-กาแลกโตไซเดส ดัชนีไกลเซมิกต่ำของมันทำให้เหมาะสำหรับใช้ในผลิตภัณฑ์อาหารเพื่อสุขภาพสำหรับผู้ป่วยเบาหวาน ดี-ราฟฟิโนสยังทำหน้าที่เป็นสารให้ความหวานพลังงานต่ำและสารกันเสียตามธรรมชาติ ช่วยยืดอายุการเก็บรักษาในกระบวนการแช่แข็งหรืออบแห้ง โดยนิยมเติมในโยเกิร์ต เครื่องดื่มหมัก และผลิตภัณฑ์เสริมอาหาร