ใช้ดีเอ็กซ์ทรันบลูเป็นตัวติดตามในงานวิจัยทางชีววิทยาและแพทยศาสตร์ โดยเฉพาะในการศึกษาการซึมผ่านของหลอดเลือดหรือการทำงานของระบบไหลเวียนเลือด เนื่องจากโมเลกุลมีขนาดใหญ่ จึงไม่สามารถผ่านผนังหลอดเลือดได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับใช้ติดตามการรั่วของของเหลวในหลอดเลือดหรือประเมินความพรุนของหลอดเลือดในเนื้อเยื่อ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การทำโครมาโตกราฟี หรือใช้ในการทดลองที่ต้องการติดสีเพื่อสังเกตการกระจายตัวของของเหลวในระบบต่าง ๆ