ใช้ดีเอ็กซ์แทรน บลูเป็นตัวติดตามในการศึกษาการไหลเวียนของเลือดและการซึมผ่านของหลอดเลือดในงานวิจัยทางชีวการแพทย์ โดยเฉพาะในแบบจำลองสัตว์ทดลอง เนื่องจากมันมีขนาดโมเลกุลใหญ่ จึงไม่สามารถผ่านผนังหลอดเลือดได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการติดตามการรั่วของโปรตีนหรือการเปลี่ยนแปลงความซึมผ่านของหลอดเลือดในภาวะต่างๆ เช่น การอักเสบหรือโรคเบาหวาน นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการแยกสารในโครมาโตกราฟีเพื่อศึกษาขนาดของโมเลกุลหรือการกรองของเยื่อในห้องปฏิบัติการ