ดี-ราฟฟิโนสถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารและเภสัชกรรมเนื่องจากคุณสมบัติพรีไบโอติก ซึ่งช่วยสนับสนุนการเจริญเติบโตของแบคทีเรียในลำไส้ที่มีประโยชน์ เช่น Bifidobacteria และ Lactobacilli ทำให้มีคุณค่าในอาหารฟังก์ชันและอาหารเสริมที่มุ่งปรับปรุงสุขภาพระบบย่อยอาหาร นอกจากนี้ยังใช้เป็นสาร стабилизаторและสารป้องกันการแช่แข็งในสูตรเภสัชกรรม ช่วยรักษากิจกรรมของชีวโมเลกุลที่ละเอียดอ่อน เช่น เอนไซม์และวัคซีนระหว่างการ lyophilization และการเก็บรักษา ในงานวิจัย ดี-ราฟฟิโนสทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการศึกษาการดูดซึมและการขนส่งน้ำตาลผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ในเซลล์ โดยเฉพาะในระบบชีววิทยาและชีวเคมี เป็น substrate ที่เลือกเฉพาะในสื่อเพาะเลี้ยงจุลินทรีย์เพื่อแยกแยะสายพันธุ์แบคทีเรียตามความสามารถในการเมแทบอลิซึมคาร์โบไฮเดรตที่ซับซ้อน นิยมใช้เป็นแหล่งคาร์บอนเฉพาะทางในสื่อเพาะเลี้ยงบางชนิด และเป็นมาตรฐานในการวิเคราะห์โครมาโตกราฟีสำหรับแยกน้ำตาลประเภทโอลิโกแซคคาไรด์ ในงานวิจัยด้านพืชศาสตร์ ใช้ในเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อพืชเป็นแหล่งพลังงานและตัวควบคุม osmotic เพื่อสนับสนุนการเจริญเติบโตและพัฒนาการของเซลล์ รวมถึงศึกษาบทบาทของน้ำตาลในการตอบสนองต่อความเครียดจากสิ่งแวดล้อม เช่น ความแห้งแล้งหรืออุณหภูมิสูง