Propargyl-N-hydroxysuccinimidyl ester ถูกใช้อย่างแพร่หลายในเคมีชีวภาพคอนจูเกชันสำหรับการติดฉลากชีวมวล เช่น โปรตีน เปปไทด์ และกรดนิวคลีอิก กลุ่มเอสเตอร์ที่ทำปฏิกิริยาได้ของมันช่วยให้การจับคู่ที่มีประสิทธิภาพกับอะมีนปฐมภูมิ ในขณะที่กลุ่ม propargyl ช่วยให้การฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมผ่านเคมีคลิก โดยเฉพาะอย่างยิ่งการไซโคลออดดิชันอะซายด์-อัลไคน์ที่เร่งด้วยทองแดง (CuAAC) ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการพัฒนาโพรบเรืองแสง ระบบส่งยา และวัคซีนชีวคอนจูเกต นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ตัวแทนการถ่ายภาพโมเลกุลสำหรับการศึกษากระบวนการทางชีววิทยาแบบเรียลไทม์ นอกจากนี้ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการปรับเปลี่ยนพื้นผิวของวัสดุสำหรับเซ็นเซอร์ชีวภาพและโครงนุ้ยชีวฟังก์ชันนาไลซ์ในวิศวกรรมเนื้อเยื่อ