ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่เป็นสารตั้งต้นในการผลิตยา โดยเฉพาะยาที่มีโครงสร้างเป็นอนุพันธ์ของอะมีน ทำหน้าที่เป็นสารป้องกันหมู่อะมีน (amine protecting group) ระหว่างขั้นตอนการสังเคราะห์ เพื่อป้องกันไม่ให้หมู่อะมีนทำปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการ ซึ่งช่วยเพิ่มความเลือกเจาะในการสร้างพันธะเคมี หลังจากนั้นสามารถกำจัดหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) ออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้ได้ผลิตภัณฑ์สุดท้ายที่ต้องการในรูปแบบของอะมีนอิสระ นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยและพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ