ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาที่มีโครงสร้างเป็นไซโคลบิวเทน ซึ่งมีความสำคัญต่อการปรับปรุงเสถียรภาพทางเคมีและชีวภาพของโมเลกุลยา รวมถึงตัวรับประสาทส่วนกลาง (central nervous system agents) นิยมใช้ในขั้นตอนการป้องกันหมู่แอมโมเนีย (amine protecting group) ระหว่างการสังเคราะห์แบบหลายขั้นตอน เนื่องจากหมู่เบนซิลคาร์บาเมตสามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะที่ควบคุมได้ เช่น การไฮโดรจีเนชัน ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างโครงสร้างไซโคลบิวเทนเพื่อจำกัดการเคลื่อนไหวเชิงโครงสร้าง (conformational restriction) ในยา เช่น protease inhibitors และ receptor modulators ที่ต้องการความจำเพาะในการจับคู่