ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการการป้องกันหมู่อะมีน กลุ่มเทอร์ต-บิวทิลออกซิคาร์บอนิล (Boc) ให้ความเสถียรในระหว่างปฏิกิริยาหลายขั้นตอน และสามารถกำจัดได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์และเคมีเฮเตอร์โรไซคลิก โครงสร้างไซโคลเฮกซิลที่มีสเตอรีโอเคมีที่กำหนดสนับสนุนการสร้างโมเลกุลที่มีข้อจำกัดทางคอนฟอร์เมชัน ซึ่งมักพบในยาที่เล็งเป้าไปยังโรคระบบประสาทส่วนกลาง โรคเมแทบอลิซึม และภาวะอักเสบ โครงสร้างของมันยังถูกใช้ในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ เช่น ตัวทำละลาย ความเสถียรทางเมแทบอลิซึม และ bioavailability