ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการการป้องกันหมู่ฟังก์ชัน โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรได้ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการเตรียมเบต้า-บล็อกเกอร์และยารักษาโรคหัวใจและหลอดเลือดอื่นๆ ใช้กันทั่วไปในเคมีเปปไทด์และการออกแบบยา เนื่องจากความสามารถในการทำหน้าที่เป็นสารป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมีน ทำให้สามารถควบคุมสภาวะปฏิกิริยาได้โดยไม่ถูกรบกวนจากหมู่อะมีนที่ทำปฏิกิริยาได้ ยังใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตรและโพลิเมอร์พิเศษที่ต้องการความสามารถในการทำปฏิกิริยาที่ควบคุมได้ โดยสามารถกำจัดหมู่ tert-butyl carbamate ออกได้ง่ายภายหลังเมื่อไม่ต้องการแล้ว