WYE-687 dihydrochloride ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษาบทบาทของมันในฐานะตัวยับยั้ง mTOR (mechanistic target of rapamycin) ที่มีประสิทธิภาพสูงและเลือกสรรได้ดี สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการตรวจสอบเส้นทางการส่งสัญญาณในเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโต การเพิ่มจำนวน และการอยู่รอดของเซลล์ นักวิจัยใช้สารประกอบนี้เพื่อสำรวจผลกระทบต่อเซลล์มะเร็ง เนื่องจากการยับยั้ง mTOR สามารถยับยั้งการเจริญเติบโตและการลุกลามของเนื้องอก นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาที่มุ่งเน้นการทำความเข้าใจการควบคุมเมแทบอลิซึม ออโตฟาจี และการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน WYE-687 dihydrochloride เป็นเครื่องมือสำคัญในการศึกษาก่อนคลินิกที่มุ่งพัฒนาการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายสำหรับโรคที่มีการส่งสัญญาณ mTOR ผิดปกติ เช่น มะเร็งและโรคเมแทบอลิซึม