KN-93 ฟอสเฟตถูกใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกของเอนไซม์ Ca²⁺/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMKII) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในกระบวนการทางชีววิทยาหลายอย่าง เช่น การส่งสัญญาณในเซลล์ การทำงานของระบบประสาท และการหดตัวของกล้ามเนื้อ โดย KN-93 ฟอสเฟตทำหน้าที่เป็นสารยับยั้งเฉพาะเจาะจงของ CaMKII ทำให้สามารถศึกษาผลกระทบของการยับยั้งเอนไซม์นี้ในระบบต่าง ๆ ได้ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยโรคที่เกี่ยวข้องกับการทำงานผิดปกติของ CaMKII เช่น โรคหัวใจ โรคทางระบบประสาท และโรคมะเร็ง เพื่อหาวิธีการรักษาใหม่ ๆ ที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น