KN-93 hydrochloride ใช้ในการศึกษาทางวิทยาศาสตร์เพื่อยับยั้งเอนไซม์ Ca²⁺/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMKII) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในกระบวนการทางชีววิทยาหลายอย่าง เช่น การส่งสัญญาณในเซลล์ การทำงานของระบบประสาท และการหดตัวของกล้ามเนื้อ โดยการใช้สารนี้ช่วยให้นักวิจัยสามารถเข้าใจกลไกการทำงานของ CaMKII และผลกระทบที่มีต่อระบบต่าง ๆ ในร่างกาย นอกจากนี้ยังมีการศึกษาที่ใช้ KN-93 hydrochloride เพื่อสำรวจบทบาทของ CaMKII ในโรคต่าง ๆ เช่น โรคหัวใจ โรคทางระบบประสาท และโรคมะเร็ง