RNase-Free SSPE ใช้ในการทดลองทางชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในการไฮบริดไดเซชัน (hybridization) ของกรดนิวคลีอิก เช่น DNA และ RNA เนื่องจากมีความสามารถในการรักษาความเสถียรของกรดนิวคลีอิกและป้องกันการย่อยสลายโดย RNase ทำให้เหมาะสำหรับการทดลองที่ต้องการความแม่นยำสูง เช่น Northern blot, Southern blot และการทดสอบอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับการจับคู่สายกรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการเตรียมตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมและชีวสารสนเทศ โดยช่วยลดโอกาสการปนเปื้อนของ RNase ซึ่งอาจส่งผลต่อผลลัพธ์ของการทดลอง