RNase-Free SSC ใช้ในการทดลองทางชีวโมเลกุล โดยเฉพาะในการเตรียมและวิเคราะห์ตัวอย่าง RNA เพื่อป้องกันการย่อยสลายของ RNA โดยเอนไซม์ RNase ที่อาจปนเปื้อนมา การใช้งานหลักคือการทำความสะอาดและเตรียมตัวอย่าง RNA ก่อนการวิเคราะห์ด้วยเทคนิคต่างๆ เช่น Northern blot, in situ hybridization และ microarray analysis นอกจากนี้ยังใช้เป็นส่วนประกอบในขั้นตอนการล้างและเตรียมเมมเบรนในการทดลอง hybridization เพื่อให้ได้ผลลัพธ์ที่แม่นยำและเชื่อถือได้