บัฟเฟอร์ปฏิกิริยา Nuclease S1 ใช้ในการศึกษาด้านพันธุศาสตร์และอณูชีววิทยา โดยเฉพาะในการวิเคราะห์โครงสร้างของกรดนิวคลีอิก เช่น การตัดสาย DNA หรือ RNA ที่เป็นสายเดี่ยว (single-stranded) เพื่อศึกษาลำดับเบสหรือโครงสร้างทุติยภูมิ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมตัวอย่างสำหรับเทคนิคต่างๆ เช่น Northern blot, Southern blot และการวิเคราะห์การจับคู่ของกรดนิวคลีอิก (nucleic acid hybridization) ซึ่งช่วยในการวิจัยเกี่ยวกับการแสดงออกของยีนและกลไกทางพันธุกรรม