CGI-1746 ใช้หลักๆ ในสถานที่วิจัยเพื่อศึกษาบทบาทของมันในฐานะตัวยับยั้งแบบเลือกสรรของ Btk (Bruton's tyrosine kinase) สารนี้มีบทบาทสำคัญในการทำความเข้าใจหน้าที่ของ Btk ในกระบวนการส่งสัญญาณของเซลล์ภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะในเซลล์ B ซึ่งมีความสำคัญต่อการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน สารประกอบนี้ช่วยให้นักวิจัยสำรวจกลยุทธ์การรักษาที่เป็นไปได้สำหรับโรคภูมิต้านตนเอง เช่น โรครูมาตอยด์ (rheumatoid arthritis) และลูปัส (lupus) ซึ่งกิจกรรมของ Btk มักจะผิดปกติ นอกจากนี้ CGI-1746 ยังถูกใช้ในการวิจัยมะเร็งเพื่อตรวจสอบผลกระทบของมันต่อมะเร็งในเซลล์ B เนื่องจาก Btk มีบทบาทสำคัญในการรอดชีวิตและการขยายตัวของเซลล์มะเร็งบางชนิด การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงการศึกษาก่อนคลินิกที่มุ่งพัฒนาการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายสำหรับภาวะที่ขับเคลื่อนโดยสัญญาณ Btk ที่ผิดปกติ