BI-9564 ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการวิจัยมะเร็ง เนื่องจากบทบาทของมันในฐานะตัวยับยั้งแบบเลือกสรรของ BRD9 ซึ่งเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมการแสดงออกของยีน โดยการยับยั้ง BRD9 BI-9564 ช่วยให้นักวิจัยสามารถศึกษาผลกระทบของการรบกวนเส้นทางเฉพาะในเซลล์มะเร็ง โดยเฉพาะในกรณีของมะเร็งเม็ดเลือดขาวเฉียบพลัน (AML) และมะเร็งชนิดอื่นๆ สารประกอบนี้มีคุณค่าในการศึกษาก่อนคลินิกเพื่อทำความเข้าใจกลไกของ BRD9 และศักยภาพของมันในฐานะเป้าหมายการรักษา การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงการพัฒนายาใหม่สำหรับรักษามะเร็ง โดยให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการควบคุม epigenetic ของการลุกลามของมะเร็งและกลไกการดื้อยา อย่างไรก็ตาม การวิจัยยังอยู่ในขั้นต้นและจำเป็นต้องมีการศึกษาเพิ่มเติมเพื่อยืนยันประสิทธิภาพและความปลอดภัยก่อนนำมาใช้ในมนุษย์