BET-IN-2 ถูกนำมาใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างโปรตีนและการควบคุม epigenetic มันทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งที่แรงต่อโปรตีน bromodomain และ extraterminal (BET) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการแสดงออกของยีน โดยการยับยั้งโปรตีนเหล่านี้ BET-IN-2 ช่วยให้นักวิจัยสามารถสืบสวนกลไกที่อยู่เบื้องหลังโรคต่าง ๆ รวมถึงมะเร็ง การอักเสบ และโรคหัวใจและหลอดเลือด การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปสู่การค้นพบยา ซึ่งใช้ในการระบุเป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้และพัฒนาการรักษาใหม่สำหรับภาวะที่เกี่ยวข้องกับการแสดงออกของยีนที่ผิดปกติ นอกจากนี้ BET-IN-2 ยังถูกใช้ในขั้นตอนทดสอบเซลล์เพื่อทำความเข้าใจบทบาททางปฏิบัติการของโปรตีน BET ในการปรับโครงสร้างโครมาตินและการควบคุมการถอดรหัส