6-Bromo-1-hexanol ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตยา สารเคมีเกษตร และสารเคมีพิเศษ ทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยพื้นฐานสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น เช่น ที่ใช้ในการพัฒนายา อะตอมโบรมีนในสารประกอบนี้ช่วยให้สามารถปรับแต่งหน้าที่เพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการแทนที่ ทำให้มีคุณค่าสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบ เช่น สารลดแรงตึงผิว โพลิเมอร์ และน้ำหอม นอกจากนี้ ยังสามารถใช้ในการเตรียมอนุพันธ์เฮกซิล ซึ่งมีประโยชน์ในแอปพลิเคชันอุตสาหกรรมต่างๆ และในงานวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกทางเคมี