สโคปีนถูกใช้เป็นส่วนประกอบสำคัญในอุตสาหกรรมยา โดยเฉพาะในการผลิตยาที่ใช้รักษาโรคทางระบบประสาท เช่น ยาแก้เวียนหัว ยาคลายกล้ามเนื้อ และยาที่ช่วยปรับสมดุลการทำงานของระบบประสาทอัตโนมัติ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษาการทำงานของตัวรับในสมอง เนื่องจากมีฤทธิ์ในการออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลางอย่างเฉพาะเจาะจง สโคปีนจึงมีความสำคัญต่อการพัฒนายาใหม่ๆ ที่ต้องการควบคุมอาการผิดปกติของระบบประสาทอย่างแม่นยำ