ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพและผู้สมัครยา โครงสร้างบิไซคลิกที่แข็งช่วยคงรูปแบบโมเลกุลเฉพาะ ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์และตัวปรับตัวรับ ใช้กันทั่วไปในเพปไทด์มิมเมติกส์และการสังเคราะห์เฮเทอโรไซคลิก ซึ่งช่วยในการนำเสนอโครงสร้างที่มีไนโตรเจนแบบฟังก์ชันนัล กลุ่มอะมีนที่ป้องกันด้วย Boc และกลุ่มกรดคาร์บอกซิลิกช่วยในการ derivatization แบบเลือกสรร ทำให้สามารถประกอบโมเลกุลที่ซับซ้อนแบบ stepwise ในการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน นอกจากนี้ กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ยังทำหน้าที่เป็น protecting group สำหรับไนโตรเจนในโครงสร้างไซคลิกได้อย่างมีประสิทธิภาพ สามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อนๆ โดยไม่ทำลายโครงสร้างหลัก ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างสารตั้งต้นยาที่มีโครงสร้างอะมีนหรืออนุพันธ์ไฮโดรคาร์บอนที่มีไนโตรเจนในวงแหวน