ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ กลุ่มบอโรนิกแอซิดช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาครอสคัปพลิง Suzuki-Miyaura ซึ่งเป็นวิธีที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในด้านการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ โครงสร้างไพรีมีดีนมักถูกนำเข้าไปในสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น สารต้านไวรัสหรือสารต้านมะเร็ง กลุ่มไอโซ-โพรพ็อกซี่ยังช่วยเพิ่มปฏิกิริยาและความละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ ทำให้ใช้งานในกระบวนการเคมีที่หลากหลายได้ง่ายขึ้น