4-Methyl-2-(ethoxy)pyrimidine-5-boronic acid ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura reaction ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอินทรีย์ เนื่องจากสารนี้มีกลุ่ม boronic acid ที่สามารถทำปฏิกิริยากับสารประกอบที่มีกลุ่ม halide หรือ triflate ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีประโยชน์ในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารเคมีเกษตรกรรม และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการพัฒนาสารเคมีใหม่ๆ ในวงการวิจัยและอุตสาหกรรมอีกด้วย