4-Chloro-2-(n-propyl)pyrimidine-5-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาและสารเคมีทางการเกษตร นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนาวัสดุใหม่ ๆ ในอุตสาหกรรมเคมีและเภสัชกรรม