2-Methylthiazole-5-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในการทำปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการผลิตสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน เช่น ยา สารเคมีเกษตร และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ เนื่องจากมีความเสถียรและให้ผลผลิตสูง นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ โดยช่วยในการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุลเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียง