2-Fluoro-6-ethylpyridine-4-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอินทรีย์ที่มีหมู่โบรอนกับสารประกอบที่มีหมู่ฮาโลเจน ทำให้ได้สารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อนมากขึ้น นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างของสารนี้มีศักยภาพในการปรับเปลี่ยนเพื่อสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาเฉพาะเจาะจง เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านเชื้อจุลินทรีย์ ในอุตสาหกรรมเคมี ยังสามารถนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีเฉพาะทางที่ใช้ในงานวิจัยและพัฒนาผลิตภัณฑ์ใหม่ๆ ด้วย