2-Bromo-6-iodopyridine-4-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบฮาโลเจน ทำให้สามารถสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและสารเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำหน้าที่เป็นตัวกลางในการสร้างสารประกอบไพรีดีนที่มีความหลากหลายทางเคมี ซึ่งเป็นโครงสร้างพื้นฐานที่พบในสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรมหลายชนิด