ไซโคลเฮกซิลโบรอนิกแอซิดใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิ ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการเชื่อมโยงวงแหวนอะโรมาติกกับกลุ่มฟังก์ชันอื่น ๆ สารนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการผลิตยาและสารเคมีทางการเกษตร โดยช่วยในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาวัสดุใหม่ ๆ และศึกษากลไกของปฏิกิริยาเคมีต่าง ๆ