6-Morpholinopyridine-3-boronic acid ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ปฏิกิริยานี้จำเป็นสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้สามารถสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงยา สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง กลุ่มโบรอนิกแอซิดของมันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญ อำนวยการ coupling กับ aryl หรือ vinyl halides ใน presence ของตัวเร่งปฏิกิริยาพัลลาเดียม นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพและยา candidates โดยที่ morpholine และ pyridine moieties ช่วยเพิ่ม solubility และ binding affinity ความยืดหยุ่นยังขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ใช้ในการสังเคราะห์วัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และโพลิเมอร์