5-Fluoro-2-(trifluoromethyl)phenylboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีต่าง ๆ โดยเฉพาะในกระบวนการ cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอโรมาติก กระบวนการนี้มีความสำคัญในการผลิตสารเคมีสำหรับอุตสาหกรรมยา สารเคมีเกษตร และวัสดุศาสตร์ นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ (bioactive compounds) และสารประกอบที่มีคุณสมบัติเฉพาะทาง เช่น สารเรืองแสงหรือสารที่ใช้ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์