4-Iodophenylboronic acid ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิงแบบซูซูกิ-มิยาอูระ (Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions) ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสร้างโครงสร้าง biaryl ปฏิกิริยาเหล่านี้มีความสำคัญในการผลิตยา สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาเซ็นเซอร์และโพรบ เนื่องจากสามารถโต้ตอบกับไดออลและน้ำตาล ทำให้มีคุณค่าในการประยุกต์ใช้ทางชีวเคมีและการวินิจฉัย ตัวแทนไอโอดีนยังช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมได้ ส่งเสริมความหลากหลายในการสังเคราะห์เคมี