4-(Methylthio)phenylboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอสคัพปลิงแบบซูซูกิ-มิยาอูระ เพื่อสร้างสารประกอบไบอาริล ซึ่งสารประกอบเหล่านี้มีความสำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม สารเคมีเกษตร และวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการพัฒนาเซ็นเซอร์และโพรบสำหรับตรวจจับโมเลกุลทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมของเหลวผลึกและโพลิเมอร์ขั้นสูง