4-Bromo-2,5-difluorophenylboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะโรมาติกกับสารประกอบอื่นๆ สารนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนายาและสารเคมีทางการเกษตร เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งโบรอนและฟลูออรีนทำให้มีความเสถียรและสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อให้ได้สารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่ต้องการ นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยด้านวัสดุศาสตร์เพื่อพัฒนาวัสดุใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะ เช่น พอลิเมอร์หรือสารกึ่งตัวนำที่ใช้ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์