4-Chloro-3-Fluorobenzeneboronic Acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่กำหนดเป้าหมายโรคต่าง ๆ มีบทบาทสำคัญในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน นำไปใช้ในการผลิตสารเคมีทางการเกษตร เช่น สารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดศัตรูพืช ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับพัฒนาวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ เช่น เซมิคอนดักเตอร์และไดโอดแสงสว่าง (LEDs) นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษาสารประกอบที่มีบอรอนและปฏิกิริยาของพวกเขา รวมถึงการนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาวัสดุใหม่ ๆ ในอุตสาหกรรมเคมีและเภสัชกรรม