4-Fluoronaphthalene-1-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคุปปลิง (Suzuki coupling) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะโรมาติก เนื่องจากมีกลุ่มโบรอนิกแอซิดที่สามารถทำปฏิกิริยากับสารประกอบอะริลหรือวินิลฮาไลด์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ สารนี้จึงถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน เช่น ยา สารเคมีสำหรับวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ และสารเคมีสำหรับการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการพัฒนาสารเคมีที่มีคุณสมบัติเฉพาะทาง เช่น สารเรืองแสงหรือสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ