4-Ethoxy-3-fluorophenylboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอาริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มีบทบาทสำคัญในการผลิตยาและสารเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาวัสดุใหม่ เช่น โพลิเมอร์และสารเรืองแสง