(3-Chloro-2-methoxyphenyl)boronic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling แบบ Suzuki-Miyaura ซึ่งปฏิกิริยานี้ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าในการผลิตเภสัชภัณฑ์ สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงสารชีวภาพและยารักษาโรค กลุ่ม boronic acid ช่วยให้การ coupling กับ aryl halides มีประสิทธิภาพ สร้างโครงสร้างอะโรมาติกที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาเซ็นเซอร์และตัวเร่งปฏิกิริยา เนื่องจากสามารถโต้ตอบกับ diols และกลุ่มฟังก์ชันอื่นๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการวิจัยเคมียารักษา ช่วยในการค้นพบและปรับปรุงยารักษาใหม่