3-Fluoro-4-methylphenylboronic acid ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่ซับซ้อน เช่น การสร้างสารตั้งต้นสำหรับยาหรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากกลุ่มบอโรนิกแอซิดในโครงสร้างทำให้มันเป็นสารกลางที่สำคัญในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะโรมาติก นอกจากนี้ยังสามารถใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ โดยเป็นส่วนหนึ่งของโมเลกุลที่ออกแบบมาเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพหรือปรับปรุงคุณสมบัติทางเภสัชวิทยา